| 研究課題名 | ポリユビキチン化基質蛋白質の網羅的同定 |
| レコードタイプ | 研究実績報告 |
| 報告年度 | 2004 |
| 研究期間 | 2003-2004 |
| 研究課題番号 | 15790148 |
| 研究代表者 | 太田 一寿 (オオタ カズヒサ) 東京大学・大学院・新領域創成科学研究科・助手 |
| 研究代表者番号 | 00322727 |
| 研究機関 | 東京大学 研究機関番号：12601 |
| 研究種目 | 若手研究(B) 研究種目コード：260 |
| 研究分野[3] | 医化学一般 研究分野コード：6905 |
| キーワード | 出芽酵母 / ユビキチン化 / プロテオミクス |
| 研究概要 | 蛋白質のユビキチン化は、プロテアソームによる分解や、エンドサイトーシスなどの様々な生命現象を調節する重要な翻訳後修飾の一つである。従来のユビキチン化基質の同定は場当たり的で、サイクリンなどの一部の蛋白質群に集中していたが、近年、出芽酵母を用いた網羅的基質同定の結果が海外の研究グループより報告され、プロテオミクス解析へとそのフィールドを移した感がある。そこで、我々も、以前から開発してきたユビキチン化基質蛋白質の網羅的検出システムの独自性をアピールするとともに、その基質プロファイリングへの応用を試みた。 <実験結果> 昨年度に引き続き、ポリユビキチン化蛋白質を優先的に濃縮できる「パラレルタグ(PAP)法」の改良・応用を行ってきた。PAP法とは我々が独自に考案した方法で、それぞれが異なるタグで標識されたユビキチンを同時に発現させてポリユビキンチン鎖に2種類のタグを取り込ませ、次にそれぞれのタグに対するアフィニティ精製を連続して行うシステムである。これにより、ポリユビキチン化蛋白質を選択的、高純度に精製する事が可能となる。 実際に、PAP法で得られたサンプルをLC/MS/MSで解析したところ、既知のものを含め130種以上の基質蛋白質候補が同定された。そこでそのうち新規のものに個別に検討を加えたところ、約80%程度においてユビキチン化が確認され、中には刺激によるユビキチン化の程度に変動が認められたものもあった。 また、基質プロファイリングへの第一歩として、F-box蛋白質:MET30p過剰発現下での基質蛋白質:MET4pのPAP法による濃縮状況を調べたところ、MET30p依存的なユビキチン化MET4p収量の増減を認め、網羅的プロファイリングへの応用が可能であると判断した。 |
| 発表文献 | Onda M, Ota K, Chiba T, Sakaki Y, Ito T.：
"Analysis of gene network regulating yeast multidrug resistance by artificial activation of transcription factors : involvement of Pdr3 in salt tolerance."
Gene. 332.
51-59
(2004)
Feng SY, Ota K, Yamada Y, Sawabu N, Ito T.： "A yeast one-hybrid system to detect methylation-dependent DNA-protein interactions." Biochem Biophys Res Commun. 313(4). 922-925 (2004) |