リボゾームDNA解析による病原真菌の同定型別と遺伝子診断に関する研究


研究課題名 リボゾームDNA解析による病原真菌の同定型別と遺伝子診断に関する研究
レコードタイプ 研究実績報告
報告年度 2003
研究期間 2002-2003
研究課題番号 02F00704
研究代表者 槇村 浩一  (マキムラ,コウイチ) 帝京大学・医学部・助教授
研究機関 帝京大学 研究機関番号:32643
研究分担者 Hamal Petr  (ハマル ペーター)  帝京大学・医真菌研究センター.  外国人特別研究員  
研究種目 特別研究員奨励費 研究種目コード:500
審査区分 外国 区分コード:22
研究分野[2] 細菌学(含真菌学) 研究分野コード:614
キーワード 病原真菌 / 遺伝子同定 / DNA塩基配列 / パルスフィールド電気泳動法 / 核型解析 / 遺伝子データベース / 疫学解析 / 感染管理
研究概要 病原真菌遺伝子の核型および塩基配列の決定として、充分な塩基配列データが得られていないアスペルギルス症起因菌および、本邦に特異的な夏型過敏性肺臓炎起因菌をはじめとした、形態学的に同定困難な菌種菌株の基準株・臨床分離株(100-200株程度)を用意し、パルスフィールド電気泳動法による核型解析を行なうと共に、菌種特異的な塩基配列(28S,ITS1 rDNA)の塩基配列を決定しつつある。
また、遺伝子塩基配列データベースの開発と、本データベースを用いた分子生物学的菌種・菌株の同定・型別法を開発するとともに、本研究によって決定した塩基配列解析と、現在迄に得られた信頼できる塩基配列と共にデータベース化し、クラスター解析を加えることによって、主要病原真菌およびその近縁菌種に関してgenospeciesを定義しつつある。この結果得られるgenospecies rDNA塩基配列(標的配列)を用いた実用化研究として、設計が容易なPCR、簡便であるがプライマーの設計が困難なLAMP法による検出同定システムを併せて作成する。このシステムによって実用性が高く、臨床的応用に足りる分子生物学的菌種・菌株の同定・型別法を研究開発しつつある。
また、本研究の実施例として、これらの検討によるCandida属酵母の型別法を用いて、緊急に解析する必要のある本菌感染症例の疫学的事例を解明し、院内感染管理に寄与することが可能であった。
発表文献 Maebashi K ほか:   "Proliferation of Intracellular Structure Corresponding to Reduced Affinity of Fluconazole for Cytochrome P-450 in Two Low- Susceptibility Strains of Candida albicans Isolated from a Japanese AIDS Patient."  Microbiology and Immunology 47(2).  117-124  (2002)  
Kamei K ほか:   "The Trend of Imported Mycoses in Japan"  Journal of Infection and Chemotherapy 9.  16-20  (2003)  
Sugita C ほか:   "A case of pulmonary aspergilloma molecular biological identification and typing of the isolates from antemortem sputa and autopsy fungus ball"  Mycoses 46(3-4).  149-152  (2003)  
Naoko Hattori, ほか:   "A Case of Kerion Celsi due to Arthroderma benhamiae Based on DNA Sequences of Nuclear Ribosomal Internal Transcribed Spacer 1 Regions"  Medical Mycology 41(3).  249-251  (2003)  
槇村浩一:   "真菌感染症の各種検査法. V.感染症に対する検査法の進歩.新世紀の感染症学(下)-ゲノム・グローバル時代の感染症アップデート-"  日本臨牀 61(増刊3).  344-349  (2003)  
槇村浩一:   "真菌症遺伝子診断の現状"  医学のあゆみ 205(12).  940-941  (2003)  
槇村浩一, ほか:   "動物由来感染症-その診断と対策"  真興交易.  275  (2003)  
槇村浩一, ほか:   "臨床検査項辞典"  医歯薬出版.  1190  (2003)  


 

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