固体高分解能NMR分光法による人工生体膜中ペプチドの精密立体構造解析


研究課題名 固体高分解能NMR分光法による人工生体膜中ペプチドの精密立体構造解析
レコードタイプ 研究実績報告
報告年度 1996
研究期間 1996-1996
研究課題番号 08640652
研究代表者 内藤 晶  (ナイトウ アキラ) 姫路工業大学・理学部・助教授
研究代表者番号 80172245
研究機関 姫路工業大学 研究機関番号:24503
研究分担者 斉藤 肇(サイトウ ハジメ):姫路工業大学・理学部・教授 (30100150)
辻 暁(ツジ サトル):姫路工業大学・理学部・助手 (60227387)
研究種目 基盤研究(C) 研究種目コード:320
審査区分 一般 区分コード:03
研究分野[2] 物理化学 研究分野コード:341
キーワード 固体高分解能NMR / REDOR / 原子間距離 / 立体構造 / オピオイドペプチド / エンケファリン / ダイノルフィン / 生体膜
研究概要 本研究では原子間距離を精密に測定する回転エコ-二重共鳴法(REDOR)の手法を用いて、固体状態および生体膜中でのペプチドの立体構造を精密に決定する方法論の確立と応用を目的として研究を行った。
1.立体構造を決定する対象として鎮痛作用のある5量体オピオイドペプチドであるLeu-エンケファリンを選んだ。まず、隣り合うペプチド面に位置するアミド窒素とカルボニル炭素をそれぞれ安定同位体^<15>Nと^<13>Cで二重標識したペプチドを6種類化学合成し、さらに結晶化した。次に、合成した各ペプチドの二重標識位置の原子間距離を精密に測定し二面体角情報に変換した。その結果から、Leu-エンケファリンについては、N末端とC末端付近はextended構造であり、分子の中心付近で折れ曲がった構造をとっていることが判明した。この構造はこれまでにX線回折の研究から得られている構造と違った構造であることが分かった。
2.エンケファリンと同様にオピオイドペプチドであるが、その活性がエンケファリンの100倍も強いダイノルフィンをリン脂質二重膜に取り込み、膜中での立体構造を、ペプチドに標識した^<13>Cの化学シフト値から決定した。その結果、生体膜中でダイノルフィンは少なくともC末端から12番目のLeuまでのα-ヘリックス構造をとっていることが判明した。さらに、^<31>P NMRを測定した結果、ダイノルフィン分子は生体膜の相転移点付近で生体膜を可逆的に細分化したり、融合する性質のあることが判明した。さらに精密な立体構造を決定するため、二重標識ダイノルフィンを化学合成し、REDOR法を適用して、膜中の立体構造を決定する計画である。
発表文献 Atsuo Tamura: "Dynamics of the three methioyl side chains of Steptomyces subtilisin inhibitor. Deuterium NMR studies in solution and in the solid state" Protein Science. 5. 127-139 (1996)
Satoru Tuzi: "Conformation and dynamics of [3-^<13>C] Ala-labeled bacteriorhodopsin and bacterioopsin, induced by interaction with retinal and its analogs, as studied by ^<13>C nuclear magnetic resonance" Biochemistry. 23. 7520-7527 (1996)
Satoru Tuzi: "Temperature-dependent conformational change of bacterio rhodopsin as studied by solid-state ^<13>C NMR" Eur. J. Biochem.239. 294-301 (1996)
Akira Naito: "State-correlated two-dimensional NMR spectroscopy : Separation of local dipolar fields of protons in nematic phase of 4′-methoxybenzylidene-4-acetoxyaniline" J. Chem. Phys.105. 4504-4510 (1996)
Akira Naito: "Deternination of the three-dimensional structure of a new crystalline form of N-acetyl-Pro-Gly-Phe as revealed by ^<13>C REDOR, X-ray diffraction, and molecular dynamics calculation" J. Phys. Chem.100. 14995-15004 (1996)
Misako Aida: "Molecular dynamics simulations of a simple tripeptide, N-acetyl-Pro-Gly-Phe in the crystalline state : distinction of the β-turn type I from the type II form" J. Mol. Struct.388. 187-200 (1966)


 

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